Es una población situada al borde de la comarca de Juarros, en la orilla izquierda del Arlanzón. Su nombre se debe al célebre San Emiliano, llamado por el pueblo Millán, cuyo monasterio es una de las referencias más constantes de la Cultura y del Monacato en los siglos medievales de Castilla. Históricamente cabe destacar el monasterio de San Cristóbal y la iglesia de Santa María, la vieja, que estaba junto al monasterio. Algunos poblamientos que fueron absorbidos en el Medioevo y engrandecieron a San Millán y fueron; Molintejado, Quintanilla de la Vega, San Andrés de Juarros, y Villasandino. La pieza fundamental fue el monasterio de San Cristóbal, de fecha incierta, y seguramente creado como un monasterio familiar. En esa época cualquier creyente podía alzar una iglesia o monasterio aportando bienes. Sólo se necesitaban tres personas que se comprometieran a vivir bajo una regla monástica y en la obediencia de uno de ellos, sacerdote denominado abad.
En 1151 entregaron el monasterio de San Cristóbal a la Orden Blanca de Premontréo de San Norberto, llamados en España Premostratenses. De Francia vinieron los fundadores trayendo libros litúrgicos, códices y otros valores. La presencia de los monjes fue intensa en Juarros. Las principales parroquias fueron regentadas por ellos. El convento no fue grande ni suntuoso, pero si lo suficientemente bueno en varios ciclos artísticos para lamentar su desaparición a mediados del siglo XIX.
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